文献综述
文 献 综 述引言启动子对酿酒酵母(S. cerevisiae)的遗传回路和代谢途径进行微调,在调控基因表达中起着至关重要的作用。
然而,酿酒酵母天然启动子存在一些局限性,阻碍了其在代谢工程中的应用。
这些限制包括被充分表征的启动子数量不足、动态范围较差以及对内源调控的正交性不足。
因此,有必要进行启动子工程,以获得性能更好的合成启动子。
已有研究根据启动子结构的特点,建立了一些数学算法以预测启动子强度。
例如,De Mey等人建立了一种偏最小二乘回归法,该方法可以将启动子强度与-10取和-35区中的特征以及间隔物的长度相联。
大多数启动子的结构及其精确位置尚未经过实验确定。
目前已有多种平台提供启动子位置预测方案,例如基于sigma-70识别的BPROM程序,可用于预测原核生物启动子;基于线性判别函数的PromH程序,可用于预测真核生物启动子。
但是,这些方法通常并不准确。
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