一、研究目的Pre-mRNA经历可变剪接（Alternative splicing，简称AS）成为成熟的mRNA，在这个过程中，许多剪接因子（Splicing Regulator/Factor,简称SR/SF）调控特定位点的剪接方向。
为实现用户通过上传自己的数据以预测在用户研究的系统中不同条件和过程中发生变化的关键可变剪接因子，现根据实验室开发的可变剪接因子预测的新的算法，构建基于服务器的线上工具分析平台。
二、研究背景及意义通过RNA-Seq和微阵列我们可得到细胞中基因的转录谱。
除了调控mRNA丰度外，RNA剪接在多个生物学过程中也起着关键作用，如发育[1]、癌症[2]和许多其他疾病[3]。
mRNA的剪接调控在空间上是多样化的(选择性第一个外显子、跳过外显子、内含子保留、选择性最后一个外显子)，甚至一个单一的剪接事件也可以被多个因素调节[4]。
由于RNA剪接的重要性和复杂性，许多人开发了分析剪接事件（如跳过外显子等五个或者更多的剪接事件）的工具。
然而，几乎所有可用的工具仅识别改变后的单个剪接事件(https://omictools.com/alternative-splicing2-category)，目前没有工具可以预测发生全基因组剪接的可变剪接调控因子，因此实验室开发了根据转录谱数据进行可变剪切因子预测的新的算法。
ISR建立在如果在疾病/扰动条件下的差异剪接是由一个特定的剪接因子调节的，那么在该因子调节下观察到的剪接变化和预测的剪接变化之间应该有高度的一致性的假设上。
ISR可以被理解为对差异拼接外显子链表的拼接集富集分析的定向版本。
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