机器学习与药物发现文献综述

 2022-12-29 19:00:50

【课题研究背景和意义】

异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)是参与三羧酸循环的重要酶,催化异柠檬酸转化为alpha;-酮戊二酸(alpha;-KG);而突变的IDH则会将alpha;-KG转化为致瘤代谢物D-2-羟戊二酸(D-2HG),同时会导致DNA和组蛋白过甲基化。

人体有三种IDH酶,分别是:胞质DADP-IDH1、线粒体NADP-IDH2、线粒体NAD-IDH3。

IDH1与IDH2是同工异构酶,结构相似。

IDH突变存在于低级胶质瘤、二级恶性胶质瘤、黑色素瘤、血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤、骨髓增生性瘤和骨髓增生异常综合征以及急性骨髓白血病中。

IDH的突变位点在IDH1和IDH2上,通过将IDH1和IDH2作为抑制靶标,使用IDH抑制剂,可使D-2HG减少,诱导组蛋白去甲基化,从而抑制肿瘤发展。

因此,IDH抑制剂,可能是治疗癌症的新途径。

IDH抑制剂按靶点分为三类:突变IDH1抑制剂、突变IDH2抑制剂、突变IDH1/IDH2抑制剂。

目前,Agios制药公司率先研发出第1个IDH1抑制剂AGI-5198和第1个IDH2抑制剂AGI-6780。Agios 制药公司之后又相继研发出了效果更好的IDH1抑制剂AG-120,IDH2 抑制剂AG-221和最新研发的IDH1 /IDH2抑制剂AG-881,目前这3个抑制剂均处于临床阶段。此外,Hyo-Joon Kim 等研发了IDH1潜在抑制剂小分子NO.398葛兰素史克公司研发出IDH1潜在抑制剂小分子 GSK321,拜耳公司研发出了IDH1抑制剂BAY-1436032,诺华公司研发出了IDH1抑制剂IDH305,美国马萨诸塞州的FormaTherapeutics机构研制了IDH1抑制剂FT-2012。

有关报道显示,IDH抑制剂主要通过高通量筛选得到活性较高的化合物。

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