血液肿瘤融合基因检测中RNA文库构建方法建立文献综述

 2023-02-05 21:11:02

一、实验背景在肿瘤发生时,经常会发生基因组水平的断裂和重新拼接。

当两个或多个基因的编码区断裂,并与别的基因连接,则有可能形成位于同一套调控序列之下的新基因片段,这就是融合基因,其有可能是染色体易位、中间缺失或染色体倒置所致的结果。

基因融合与某些疾病,尤其是某些癌症的产生密切相关,它可能使癌基因与强启动子融合而表达上调,或表达活性异常的融合蛋白,从而导致癌症形成。

因此,对融合基因进行检测,对于临床诊断和判断预后具有十分重要的意义,对临床选择靶向药物也有重要的指导作用。

例如当22号染色体的长臂与9号染色体发生易位形成新的染色体时,会使相关基因重排,这种重排方式将BCR基因的5端的部分基因和ABL1基因的3端的部分序列连接在一起,形成一个新的融合蛋白BCR-ABL1,该蛋白具有很强的酪氨酸激酶活性,会导致急性淋巴细胞白血病(ALL)。

基于此,人们开发出靶向药物格列卫,针对的就是BCR-ABL1融合蛋白。

再比如急性髓系白血病(AML),一种常见的恶性血液病,其中RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性 AML的发病率占AML的12%~15%。

RUNX1-RUNX1T1融合基因是由21号染色体与8号染色体易位形成,合并此类融合基因的白血病采用高剂量化疗或 auto-HSCT即可取得较好预后。

要进行融合基因检测,需要获取肿瘤组织或者肿瘤细胞,临床上通常有以下几种方式:①肿瘤切除手术中得到肿瘤组织②穿刺活检样品,在局部麻醉下,用很细的针刺入肿瘤组织中,来获取少量细胞用于分析③胸腹水中得到肿瘤细胞④血液样本或骨髓样本。

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