文献综述
随着近几年的研究，人们发现这种存在于中心法则之外的表观遗传学在真核生物的生命活动中扮演着重要的角色。DNA甲基化是一种重要的表观遗传学调控方式。它参与很多高等生物生命活动的调节。一方面，DNA甲基化与胚胎发育、基因印记、X染色体失活、维持细胞正常生理功能有关。另一方面，肿瘤的发生和发展与DNA甲基化也有密切的关系。异常甲基化则可使该基因表达受影响。在人类基因组中CpG虽仅占5%-10%,但是其中70%~80%的CpG都发生了甲基化。
针对表观遗传修饰在肺癌早期检测的研究主要集中在miRNAs 与lncRNAs、组蛋白修饰、DNA甲基化。现在有很多研究表明包括在肺癌和其他多种肿瘤中miRNA的失调会影响肿瘤原癌基因和肿瘤抑制基因的表达。经过高通量的深度测序数据分析发现miR-186、miR-886-3p可以作为一种肺癌预后的生物标志物。甲基化异常被认为是肿瘤发生的早期事件，随着表观遗传学与肿瘤研究的迅速发展，DNA甲基化作为一种肺癌早期检测应用的研究早有报道。Paul P Anglim在同一年发表了两篇分别关于DNA甲基化作为早期检测非小细胞肺癌和肺腺癌的文章。DNA甲基化是造成基因沉默的表观遗传调控方式，它也受到外界环境影响。比如，吸烟、大气污染、化学致癌因子、酗酒等。1992年Peter A. Jones发现在P53基因第175和273位密码子区域的CG的甲基化能够引发C-T和G-A的突变，可根据设计该位点探针，而且探针还可以联合使用成为一个Pane。
RRBS适用于分析基因组内CpG富集区域的DNA甲基化谱示，特别是CpG岛、启动子、增强子等我们感兴趣的区域RRBS方法是单碱基分辨率、高效率、低成本的基因组水平DNA甲基化图谱绘制方法。利用现在学者也开发了多种DNA甲基化数据SNP的分型分析软件。但是，其灵敏度、准确率、计算速度、文件输出类型等不尽相同。主要有MethGo、BIS-SNP、MethylExtract、BS-SNPer。其中MethGo是一款重亚硫酸盐甲基化数据处理的综合软件。
参考文献：
[1] Hongshan Guo, Ping Zhu, Liying Yan, Rong Li.The DNA methylation landscape of human Early embryos[J].NATURE,2014,511:606-624
[2] Jason O Brant, Alberto Riva, James L Resnick Thomas P Yang.Influence of the Prader-Willi syndrome imprintingcenter on the DNA methylation landscape in the mouse brain[J].Epigenetics.2014 Nov,9(11):1540-56.
[3] GotoT,MonkM.Regulation of X-chromosome inactivation in development in mice and humans[J].Microbiol Mol Biol Rev.1998 Jun,62(2):362-78.
[4] Warnecke PM1,Bestor TH.Cytosine methylation and human cancer[J].Curr Opin Oncol.2000,12(1):68-73.
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